东英吉利大学的小RNA Workbench 3.0.0 Beta版_The UEA Small RNA Workbench 3.0.0 Beta

下面是“UEA小RNA工作台”的一些主要特点：

·适配器卸妆：移除适配器从原材料短读序列数据和输出数据FASTA格式的片段。

·过滤器：产生的的斯尔纳数据集，由多个用户定义的标准，包括序列长度，丰富性，复杂性，转移和去除核糖体RNA控制的筛选版本。

·miRCat（miRNA的分级）：预测斯尔纳数据集和基因组从一个成熟的miRNA及其前体。

·SiLoCo（短干扰RNA轨迹比较）：斯尔纳多个样品中的表达水平进行比较，通过分组的小RNA分为基于基因组位点上的基因位点。

·TA-siRNA的（反式作用的短干扰RNA）：预测相控TA-siRNAs的植物斯尔纳数据集。

·miRProf（miRNA的探查）：确定归miRBase小RNA匹配已知的miRNA表达水平。

·发夹注释：生成一个二级结构的RNA序列和亮点地区使用RNAplot的利益。

·VISSR（可视化个小RNA）：产生的小RNA和用户导入基因组功能的可视化表示。

·PAREsnip：通过降解组证明识别miRNA靶标