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收集
UEA小RNA工作台开发的应用程序,以帮助生物学家从植物和动物的的斯尔纳数据分析单个或多个样品。
您可以使用这个应用程序来识别有趣的神器出山:www.shenqi73.com地标(如新型微RNA序列的检测)或其他任务,如小RNA表达模式分析基因数据。
下面是“UEA小RNA工作台”的一些主要特点:
·适配器卸妆:移除适配器从原材料短读序列数据和输出数据FASTA格式的片段。
·过滤器:产生的的斯尔纳数据集,由多个用户定义的标准,包括序列长度,丰富性,复杂性,转移和去除核糖体RNA控制的筛选版本。
·miRCat(miRNA的分级):预测斯尔纳数据集和基因组从一个成熟的miRNA及其前体。
·SiLoCo(短干扰RNA轨迹比较):斯尔纳多个样品中的表达水平进行比较,通过分组的小RNA分为基于基因组位点上的基因位点。
·TA-siRNA的(反式作用的短干扰RNA):预测相控TA-siRNAs的植物斯尔纳数据集。
·miRProf(miRNA的探查):确定归miRBase小RNA匹配已知的miRNA表达水平。
·发夹注释:生成一个二级结构的RNA序列和亮点地区使用RNAplot的利益。
·VISSR(可视化个小RNA):产生的小RNA和用户导入基因组功能的可视化表示。
·PAREsnip:通过降解组证明识别miRNA靶标