WPDB数据库加载器2.0_WPDB Database Loader 2.0

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WPDB数据库加载器2.0_WPDB Database Loader 2.0

分析生物大分子三维结构的快速和容易。

WPDB数据库Loader是一个方便，易于使用的工具，专门帮助你审问生物大分子的三维结构，发现在蛋白质数据银行（PDB）使用查询和显示工具，如上面显示的。

下面是一些主要特点的神器出山:www.shenqi73.com的“WPDB数据库加载程序”：

科学：
·基于对文本结构和序列搜索（不匹配）。
·根据Needleman和Wunsch（JMB 48（3）：443-453，1970）的方法，对多个靶序列的一个寄存器序列的序列比对。
·结构叠加根据亨德里克森（鐗CrystA35 :158-163，1979的方法，使用Calpha位置。
·二级结构的分配根据的Kabsch和Sander方法。
·氨基酸的性能分布分析，静态和动态两种：静态根据编制的Bogardt等的值。动态的，平均暴露根据李和理查兹（JMB 55:379-400，1971）和实验乙factorsProfiles的一个单一的两个对齐的多肽链多肽链或不同的配置文件进行审查。
·联系在不同的距离，不同的原子团在contactSingle结构或叠加的结构（区别接触地图）的地图分析，可以检查。
·典型的3-D可视和渲染，包括选项，以显示或突出显示的子结构，CPK表示，立体声及简单曲面（彩色根据用户的距离）。
·几何计算键长，键角，二面角，非保税密切接触，包括图形表示和小分子距离的偏差。

计算：
·数据编程 - 有关在存储PDB ASCII文件分发降低了20倍，但有：（一）仅限于作者和JRNL记录的书目信息;（ii）任选的第一个或所有成员的合奏NMR或模型结构;（iii）只有第一种选择的构象的晶体结构与部分占用的部分PDB文件中定义的;（四）原子坐标舍入为2而不是3位小数;（五）没有PDB REMARK记录。
·可互操作的显示对象 - 当一个功能被选中的一个显示器的对象（e.ga联络图），其他所有可见的显示对象（e.g3-D浏览器）和所援引随后也将被更新，以说明该功能。
·直接的访问Raswin流行的分子显示程序。
·同步打印的文档和上下文相关帮助创建使用DocToHelp包。