POY 4.1.2 / 5.0.0 Beta版_POY 4.1.2 / 5.0.0 Beta

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POY /阿尔法5.0.1 4.1.2.1_POY 5.0.1 Alpha / 4.1.2.1

可靠和有用的工具，可以帮助您执行多系统发育分析，DNA和其他模拟使用动态同源性

POY是一个简单实用的系统发育分析程序，支持多种类型的数据，如核苷酸，基因和染色体。

POY特别是，它可以执行真正的神器出山:www.shenqi73.com对齐和亲缘关系推断（即输入序列不需要进行预校准）。插入，删除和重排，可以被包含在树的整体得分（下最大简约），或模型（下最大似然）。各种启发式算法已为此制定并实施POY。

此版本中的新功能：

新特点：
·报告愿为连理枝可能性字符，但
·简约分支长度不报告。新命令，允许打印
·分支长度从三个不同的方法（见下文），这些选项
·忽略的可能性，因为我们始终报告参数值，
·对数似然最大化。
·报告graphtrees，asciitrees，树木与可折叠财产有
·一直延伸到使用上述分支长度（参见命令
·下面的说明）。
·自定义的字母变换通过静态约静态特性。这
·是一个问题，可被表示为预对准的字符，并
·如何正确地变换它们之间。
·上架支持用于ocaml的PARMAP的产生成本固定状态矩阵。
·新增的指令报告（robinson_foulds）（请参阅下面的命令描述）

修正的错误：
·选择终端在ncurses造成的错误时显示，记录到一个
·不正确的窗口（路易丝·克劳利）。
·模型塞莱下的可能性转化...