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TripleC开发是一个程式,用来建构共识从扎根的三倍的树木。
用途
Triplec.jar NoReps InFile.newick的的java-jar
,这里NoReps是三重重建使用的神器出山:www.shenqi73.com共识。这是必需的,因为重建是一项随机算法。对于小乔木,约20类群重复1000就足够了。但是,较大的数字应用于更大的数据集。
InFile.newick是一个文本文件,每行一个newick树。的树木被认为是植根于每一个树必须包含的类群标签的第一棵树。这是,不能包含树后的第一个新种。
虽然有少类群的共识,作为第一棵树的树,它不是一个错误,这个方法是不是一个超级树的方法。在这些条件下的性能尚未经过测试,我们预计会表现不佳。
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